由于未知病毒的大规模流行、地壳运动,以及陨石群的突然降落,人类的活动范围被严重地限制、缩小。当旧有的人类终于从天灾人祸中恢复过来的时候,发现自己生存的七个都市之外,已经是广大的未探索的荒野,也就是所谓的“新大陆”…… 谢巴赫肯博士,人类首屈一指的金头脑,抱着对新大陆及其生态系统的无限好奇,发起和组织了新大陆探险队,在这片旧人类眼中的未开发地区上,开始了奇妙的探险。 在这里,他遇到了与自己在性格和思想上都截然相反的警备班长村上静马,并且在一个巧合的情况下,与村上形成了配偶性的体质。 而正所谓乱上添乱,新大陆人发现博士和魔神有着相同的外表,抱着仇恨对探险基地展开了攻击。与此同时,魔神蓝恩出现在基地周围,提出“原兽文书” 的话题意欲带走博士……